Uma análise mais atenta dos votos nulos computados nas disputas dos dez Estados que tiveram eleição de segundo turno para governador sugerem que houve inversão na hora da votação por parte de muitos eleitores. Segundo o Trtibunal Regional Eleitoral (TRE-PR), provavelmente, eles votaram para Presidente, quando deveriam ter votado para Governador e vice-versa. Na urna eletrônica, o eleitor deveria votar primeiro para Governador e depois para Presidente.
Dois Estados apresentaram um índice baixo de votos nulos, justamente os dois Estados onde os números dos candidatos ao Governo coincidiram com os números dos candidatos à Presidência. Em um único Estado, a Paraíba (15 / 45 e 13 / 45), existia coincidência com apenas um dos candidatos e o índice de votos nulos foi de 7,28%.
Na relação abaixo, os dois primeiros números entre parênteses se referem aos números dos candidatos ao Governo e os dois últimos se referem aos números dos candidatos à Presidência). O percentual é referente ao total de votos nulos.
PARANÁ (12 / 15 e 13 / 45) – 7,75%
SANTA CATARINA (11 / 15 e 13 / 45) – 7,89%
MARANHÃO (12 / 25 e 13 / 45) – 8,75%
RIO GRANDE DO NORTE (15 / 40 e 13 / 45) – 8,86%
GOIÁS (11 / 15 e 13 / 45) – 9,68%
PERNAMBUCO (25 / 40 e 13 / 45) – 11,68%
RIO DE JANEIRO (13 – 15 – 23 e 45) – 13,36%